在一項新的研究中,來自美國密歇根大學(xué)的研究人員對多種癌癥中的circRNA進行了編目,并進行了初步研究,表明這些穩(wěn)定的結(jié)構(gòu)可能作為血液或尿液中的癌癥生物標志物。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2019年2月7日的Cell期刊上,論文標題為“The Landscape of Circular RNA in Cancer”。
圖片來自Cell, 2019, doi:10.1016/j.cell.2018.12.021
參考資料:Josh N. Vo et al. The Landscape of Circular RNA in Cancer. Cell, 2019, doi:10.1016/j.cell.2018.12.021.
circRNA整體解決方案
萊博生物是一家綜合的科研服務(wù)機構(gòu),可為科研工作者提供基因水平、蛋白質(zhì)水平、細胞水平、組織病理檢測、動物實驗等實驗平臺。公司建立了標準化的實驗室,配備了先進的實驗儀器,可向廣大客戶朋友全程開放。同時,我司擁有數(shù)十位博士碩士專業(yè)技術(shù)人才,資深的技術(shù)老師確保全程解決方案優(yōu)化調(diào)整及實驗質(zhì)控,專業(yè)化的實驗人員也保證了實驗操作流程的規(guī)范性和實驗結(jié)果的價值。萊博生物近年來主攻miRNA、lncRNA、circRNA、外泌體等研究方向,協(xié)作了多項國家自然科學(xué)基金重大項目、面上、地區(qū)、青年項目及各省市科技項目等,為廣大客戶朋友提供了優(yōu)質(zhì)的綜合解決方案,廣受好評。
具體課題協(xié)作服務(wù)包括:
實驗設(shè)計或優(yōu)化: 您可以提供完整的課題思路交予我們進行評估優(yōu)化(或簡化),或告訴我們您的研究方向和大致期望(影響因子等),我們的技術(shù)支持團隊會根據(jù)您的經(jīng)費實際及相應(yīng)要求梳理實驗方案;
實驗開展和匯報: 嚴格根據(jù)雙方協(xié)商確定的實驗方案進行實驗,我司有完善的實驗平臺和實驗技術(shù)人員專業(yè)協(xié)作;開展過程中,我們將每月定期向您匯報實驗的進展,讓您隨時了解您實驗的動態(tài),以便根據(jù)實際情況及時調(diào)整實驗方案;
實驗報告與交流: 實驗結(jié)束后,我們將及時整理實驗結(jié)果,匯成實驗報告單,并協(xié)助分析原始數(shù)據(jù),及時進行配合交流;
寫作指導(dǎo)與編譯: 我們將針對成稿困難的客戶進行專門指導(dǎo),有需要的可提供翻譯、潤色等支持,以協(xié)助將科研成果更好更快的產(chǎn)出。
circRNA整體解決方案:
環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)是最近發(fā)現(xiàn)的一類特殊的非編碼RNA,它大量存在于真核細胞胞質(zhì)內(nèi),主要由pre-mRNA通過可變剪切加工產(chǎn)生。 近年研究發(fā)現(xiàn),circRNA具有很多重要的調(diào)控功能,例如,circRNA可以作為競爭性內(nèi)源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)結(jié)合胞內(nèi)miRNA,阻斷miRNA對其靶基因的抑制作用。除此以外,circRNA也具有調(diào)控其他類型RNA、調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)活性等功能。circRNA在不同物種中具有保守性,而且存在組織表達差異,且circRNA的環(huán)狀結(jié)構(gòu)對RNase不敏感,導(dǎo)致它比線性RNA更為穩(wěn)定,這些特性使得circRNA具有開發(fā)疾病新型診斷與治療方法的巨大潛力,研究意義重大。
服務(wù)內(nèi)容:
1)環(huán)狀RNA生物信息學(xué)預(yù)測
2) 環(huán)狀RNA高通量測序
3)環(huán)狀RNA表達豐度檢測
4)FISH 檢測環(huán)狀RNA的亞細胞定位
5)NorthernBlot 檢測環(huán)化RNA的存在
6)環(huán)狀RNA的過表達實驗(Gain of function)
7)環(huán)狀RNA功能缺失實驗(Loss of function )
8)環(huán)狀RNA與miRNA互作結(jié)合生物預(yù)測及實驗驗證
9)環(huán)狀RNA與miRNA相互作用預(yù)測研究
10)環(huán)狀RNA與蛋白相互作用研究
circRNA的形成(A)以及作用機制(B)
重要意義:
在對circRNA 結(jié)構(gòu)和功能研究的基礎(chǔ)上,有研究人員發(fā)現(xiàn)它們在動脈粥樣硬化,神經(jīng)系統(tǒng)紊亂,糖尿病和腫瘤等疾病發(fā)生過程中,發(fā)揮非常重要的作用。對環(huán)狀RNA研究具有重要的意義:
1)circRNA獨具的競爭性內(nèi)源(ceRNA)特征可為藥物開發(fā)提供新的思路;
2)circRNA的組織特異性和穩(wěn)定性有可能使circRNA成為一種良好的生物標志物;
3)circRNA 的研究為生命的進化研究提供新的方向。
circRNA相關(guān)數(shù)據(jù)庫:
circBase: http://www.circbase.org/
circNET: http://circnet.mbc.nctu.edu.tw/
StarBase V2: http://deepbase.sysu.edu.cn/
CircInteractome: http://circinteractome.nia.nih.gov/
Circ2Traits: http://gyanxet-beta.com/circdb/
CSCD: http://gb.whu.edu.cn/CSCD
exoRBase: http://www.exoRBase.org